on the use of the infrastructure facility (AnBioTech SIO), which includes the
Center for Biological Resources and Bioengineering of Farm Animals,
Unique Scientific Set (USS) "Gene Pool of Animal and Avian Genetic Material" and the experimental laboratory base, please contact by e-mail: This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it.
Animal Biotechnology Scientific Infrastructure Object (AnBioTech SIO) was created according to the L.K. Ernst Federal Research Center for Animal Husbandry Order no. 165 of December 28, 2017 to conduct research on biotechnology of farm, commercial and relative animal species. The Object includes the following infrastructure units of the Center:
Center for Collective Use of Scientific Equipment (CCU), Farm Animal BioResources and Bioengineering (December 01, 2008; registration no. 3221, Ministry of Education and Science, Russian Federation)
Unique Scientific Set (USS), Gene Pool of Animal and Bird Genetic Material (created December 30, 2016; registration no. 498808, Ministry of Education and Science, Russian Federation)
Laboratory Experiment Base involves the special rooms designed to perform the surveys of different types including the pedigree genetic material expertise (Certificate of Molecular Genetics Laboratory Registration no. 502512830000 as of November 9, 2017, State Register of Breeding) and work-ups of pathogenic microorganisms of Risk Groups III and IV.
Users of AnBioTech SIO can access the developed methods, the created and maintained livestock resource population datasets, and the databases of the genetic (STR, DNA markers linked to QTL, and the genes associated with inherited diseases), genomic (mitochondrial genomes and whole genome SNP markers), and phenotypic variations (including the mass spectrometry of tissues) in the farm animals and avian species. The objectives of the AnBioTech SIO are to improve the unique equipment efficiency, the scientific installations, and the specialized rooms and to provide the external user access to the methods for variations, the resource (model) population datasets, and the databases of genetic, genomic, and phenotypic variations in the farm animals and avian species to perform R&D to basic and applied research.
The directions of research based on AnBioTech SIO are:
Animal Molecular Genetics, Head is O. V. Kostynina, Doctor of Biological Sciences, Principal Scientist;
Population Genetics and Animal Breeding, Head is A. A. Sermyagin, Candidate of Agricultural Sciences, Principal Scientist;
Bioinformatic Molecular Data Analysis, Head is A. V. Dotsev, Candidate of Biological Sciences, Principal Scientist;
Experimental Embryology, Head is G. N. Singina, Candidate of Biological Sciences, Principal Scientist;
Avian Cell Engineering, Head is N. A. Volkova, Doctor of Biological Sciences, Professor, Russian Academy of Sciences, Chief Scientist;
Farm Animal Biochemistry, Head is N. V. Bogolyubova, Candidate of Biological Sciences, Principal Scientist;
Microbiology, Head is O. A. Artemieva, Candidate of Biological Sciences, Principal Scientist.
Laboratory Experiment Base
| № | Database Name | Brief Description of Database | Responsible Person |
|---|---|---|---|
| 1 | Database of STR Variation in Domestic Cattle Breeds (Bos taurus) | The database contains the information on the cattle breed and population genotypes for 12 Bos taurus microsatellite loci recommended by ISAG. The database contains the DNA profiles for more than 10 thousand specimens of 17 breeds | Volkova, V.V., Candidate of Biological Sciences, Senior Staff Scientist |
| 2 | Database of STR Variation in Domestic Yak (Bos mutus) | The database contains the information on the genotypes of different yak ecotypes for 12 Bos taurus microsatellite loci recommended by ISAG. The database contains the DNA profiles for more than 200 heads of yak of 4 different ecotypes. | Gladyr, E.A., Candidate of Biological Sciences, Lead Staff Scientist |
| 3 | Database of STR Variation in European Wisent (Bison bonasus) | The database contains the information on the genotypes of different wisent populations for 12 Bos taurus microsatellite loci recommended by ISAG. The database contains the DNA profiles for more than 100 heads of wisent of 4 different populations. | Kostyunina, O.V., Doctor of Biological Sciences, Lead Staff Scientist |
| 4 | Database of STR Variation in Domestic Swine (Sus Scrofa) | The database contains the information on the different swine breed and population genotypes for 12 Sus Scrofa microsatellite loci recommended by ISAG. The database contains the DNA profiles for more than 20 thousand specimens of 15 breeds. | Kharzinova, V.R., Candidate of Biological Sciences, Lead Staff Scientist |
| 5 | Database of STR Variation in Domestic Sheep (Ovis aries) | The database contains the information on the different sheep breed and population genotypes for 12 Ovis aries microsatellite loci recommended by ISAG. The database contains the DNA profiles for more than 3 thousand specimens of 35 breeds. | Deniskova, T.E., Candidate of Biological Sciences, Lead Staff Scientist |
| 6 | Database of STR Variation in Bighorn Sheep (Ovis nivicola) Markers | The database contains the information on the different Bighorn sheep genotypes for 12 Ovis Aries microsatellite loci recommended by ISAG. The database contains the DNA profiles for more than 200 specimens of 5 different Bighorn Sheep subspecies. | Deniskova, T.E., Candidate of Biological Sciences, Lead Staff Scientist |
| 7 | Database of STR Variation in Domestic Goats (Capra chircus) | The database contains the information on the goat breed and population genotypes for 9 Capra chircus microsatellite loci recommended by ISAG. The database contains the DNA profiles for more than 300 specimens of 4 breeds. | Petrov, C.N., Candidate of Biological Sciences, Senior Staff Scientist |
| 8 | Database of STR Variation in Reindeer (Rangifer tarandus) | The database contains the information on the reindeer breed and population genotypes for 9 Rangifer Tarandus microsatellite loci. The database contains the DNA profiles for more than 400 specimens of 4 breeds of domestic reindeer and 7 populations of wild reindeer. | Kharzinova, V.R., Candidate of Biological Sciences, Lead Staff Scientist |
| 9 | Database of STR Variation in Honeybee (Apis melifera) | The database contains the information on the honeybee breed and population genotypes for 9 Apis mellifera microsatellite loci. The database contains the DNA profiles for more than 1000 specimens of 4 breeds of honeybee. | Fornara, M.C., Candidate of Biological Sciences, Senior Staff Scientist |
| 10 | Database of Genome Variation in Domestic Cattle Breeds | The database contains the information on the whole-genome SNP profile of different cattle breeds and populations produced with the use of both the moderate-density DNA chips: Bovine SNP50 BeadChip, Illumina (>50 thousand. SNP) and Bovine HD BeadChip, GeneSeek/Neogen (>150 thousand. SNP) and the high-density DNA chips: Bovine HD BeadChip, Illumina (>700 thousand SNP). The database contains the DNA profiles for more than 200 heads of cattle of 10 breeds. | Dotsev, A.V., Candidate of Biological Sciences, Lead Staff Scientist |
| 11 | База данных геномной вариабельности племенных быков-производителей и коров голштинской, черно-пестрой и симментальской пород | База данных содержит информацию о полногеномных SNP-профилях быков-производителей и коров голштинской, черно-пестрой и симментальской пород, полученных с использованием ДНК-чипов средней плотности: Bovine SNP50 BeadChip, Illumina (>50 тыс. SNP) и Bovine HD BeadChip, GeneSeek/Neogen (>150 тыс. SNP). В базе данных имеются ДНК-профили более1000 голов крупного рогатого скота. | Сермягин А.А., в.н.с., к.с.-х.н. |
| 12 | База данных геномной вариабельности зубра | База данных содержит информацию о полногеномных SNP-профилях ппопуляций зубра, полученных с использованием ДНК-чипов средней плотности: Bovine SNP50 BeadChip, Illumina (>50 тыс. SNP) и Bovine HD BeadChip, GeneSeek/Neogen (>150 тыс. SNP) и высокой плотности: Bovine HD BeadChip, Illumina (>700 тыс. SNP). В базе данных имеются ДНК-профили более 50 голов зубра. | Доцев А.В., в.н.с., к.б.н. |
| 13 | База данных геномной вариабельности свиней пород крупная белая, ландрас и дюрок | База данных содержит информацию о полногеномных SNP-профилях хряков-производителей и свиней пород крупная белая, ландрас и дюрок, полученных с использованием ДНК-чипов средней плотности: Porcine HD BeadChip, GeneSeek/Neogen (>60 тыс. SNP). В базе данных имеются ДНК-профили более1500 голов свиней. | Сермягин А.А., в.н.с., к.с.-х.н. |
| 14 | База данных геномной вариабельности домашних овец | База данных содержит информацию о полногеномных SNP-профилях овец различных пород, полученных с использованием ДНК-чипов средней плотности: Ovine SNP50 BeadChip, Illumina (>50 тыс. SNP) и высокой плотности (Ovine HD BeasdChip, Illumina (>600 тыс. SNP). В базе данных имеются ДНК-профили более 700 голов овец. | Доцев А.В., в.н.с., к.б.н. |
| 15 | База данных геномной вариабельности диких Ovis | База данных содержит информацию о полногеномных SNP-профилях различных диких видов Ovis - архара, муфлона, уриала, снежного барана, полученных с использованием ДНК-чипов средней плотности: Ovine SNP50 BeadChip, Illumina (>50 тыс. SNP) и высокой плотности (Ovine HD BeasdChip, Illumina (>600 тыс. SNP). В базе данных имеются ДНК-профили более 250 голов диких Ovis. | Доцев А.В., в.н.с., к.б.н. |
| 16 | База данных геномной вариабельности Capra | База данных содержит информацию о полногеномных SNP-профилях различных пород домашних коз и диких видов Capra - кавказского тура, сибирского козерога, мархура и др., полученных с использованием ДНК-чипов средней плотности: Caprine SNP60 BeadChip, Illumina (>60 тыс. SNP). В базе данных имеются ДНК-профили более 90 голов домашних диких Capra. | Доцев А.В., в.н.с., к.б.н. |
| 17 | База данных геномной вариабельности северного оленя | База данных содержит информацию о полногеномных SNP-профилях различных домашних и диких популяций северного оленя, полученных с использованием ДНК-чипов средней плотности: Bovine SNP50 BeadChip, Illumina (>50 тыс. SNP) и и высокой плотности: Bovine HD BeadChip, Illumina (>700 тыс. SNP). В базе данных имеются ДНК-профили более1000 голов крупного рогатого скота. | Доцев А.В., в.н.с., к.б.н. |
| 18 | База данных последовательности цитохрома B (CytB) снежного барана (Ovis nivicola) | База данных содержит информацию о полной последовательности цитохрома B различных подвидов и группировок снежного барана. В базе данных имеются последовательности CytB более150 голов снежного барана. | Костюнина О.В., в.н.с., д.б.н. |
| 19 | База данных последовательности полного митохондриального генома снежного барана (Ovis nivicola) | База данных содержит информацию о последовательности полного митохондриального генома различных подвидов и группировок снежного барана. В базе данных имеются последовательности CytB более100 голов снежного барана. | Доцев А.В., в.н.с., к.б.н. |
| 20 | База данных происхождения, хозяйственно-полезных признаков и показателей экстерьера коров | База данных содержит информацию о родословной, уровне развития хозяйственно-полезных признаков (молочная продуктивность, показатели воспроизводства, показатели здоровья) и экстерьерных показателях коров из племенных заводой РФ. В базе данных содержится информация о более 100 тыс. коров. | Сермягин А.А., в.н.с., к.с.-х.н. |
| 21 | Базза данных инфракрасных спектров молока коров | База данных сожержит информацию о более 15 показателях, полученных при анализе проб молока коров с использованием инфракрасного детектора. В базе данных содержится информация о ИК-показателях молока более 10 тыс. коров. | Сермягин А.А., в.н.с., к.с.-х.н. |
| 22 | База данных ежедневных индивидуальных показателей живой массы, потребления корма и показателей кормового поведения свиней | База данных сожержит информацию о ежедневных индивидуальных показателях живой массы, потребления корма и 5 признаков кормового поведения хряков породы дюрок. В базе данных содержится информация о более 200 свиней. | Белоус А.А., м.н.с. |
| №0600-2014-0005.4. |
